Introduzione a R per la manipolazione efficace di dati (Intro2R)

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Corso “Intro2R”

Descrizione

Corso intensivo che introduce all’uso di R come strumento di analisi e come linguaggio di scripting per la manipolazione e la gestione dei dati.
Per seguire questo corso NON è necessaria alcuna conoscenza pregressa. L’iscrizione a questo corso dà diritto al 10% di sconto sull’acquisto dei corsi intermedi “FunGR – Dai geni ai pathways” (Giugno 2019) e “R4BS – Statistica con R” (Ottobre 2019).

Scopo del corso

Acquisire le basi del linguaggio R e acquisire la minima indipendenza per affrontare corsi più avanzati o veri e propri corsi di programmazione; far proprio il nuovo moderno paradigma di gestione efficiente dei dati; intraprendere il cammino di illuminazione verso l’autonomia gestionale dei propri dati.

In particolare: Imparare come manipolare, trasformare, e gestire in maniera efficiente dati di tipo tabellare e dati di tipo biologico con le funzioni avanzate di R e RStudio. Filtrare, estrarre righe e colonne, fare operazioni complesse in maniera automatica e semiautomatica, pulire i datasets per prepararli alle analisi; superare le limitazioni di Excel nella gestione di file grandi (big data). Imparare come evitare i limiti imposti dai software commerciali e l’uso di metodi per lo sfruttamento delle piene potenzialità del proprio computer. Il corso è disegnato su esempi di dati di tipo biologico/genomico ma prescinde da questi ed è utile anche per gli altri settori non biomedici.

Che cosa si impara

  • Come installare ed usare R e RStudio. Le basi del linguaggio e le strutture dati.
  • Concetti di pulizia dei dati (data tidyness).
  • Manipolazione di dati tabellari: come leggere, trasformare, filtrare, aggregare, fare calcoli semplici (o complessi) su dati tabellari da poche fino a milioni di righe e/o colonne.
  • Come automatizzare le operazioni per risparmiare tempo (e fare meno errori) nel proprio lavoro di manipolazione dati.
  • Grafica: come produrre grafici avanzati (e accattivanti) quali box plots, violin plots, scatters, heatmaps e come iterare in automatico la loro produzione su molti dati.

A chi è indirizzato questo corso

Questo è un corso introduttivo al linguaggio R rivolto principalmente a BIOLOGI, TECNICI di LABORATORIO, ANALISTI, CLINICI e MEDICI; in generale ogni PROFESSIONISTA delle scienze della vita ne beneficerebbe. NON è richiesta una conoscenza pregressa del linguaggio R, ma occorre avere le capacità minime di utilizzo del computer e dotarsi di un computer portatile recente da portare in aula durante il corso.
Durante il corso, altamente pratico, verranno utilizzati dati provenienti dal dominio biomedico (dati di espressione genica, tabelle cliniche), ma le metodologie e il razionale di utilizzo del software esposti sono del tutto generali e sono applicabili a qualsiasi altro dominio. Per questo motivo il corso è adatto anche a chiunque, provenendo da altri settori quali finanza, amministrazione, scienze sociali, volesse avere una introduzione pratica ed efficace al linguaggio R.
Il corso prevede inoltre un periodo iniziale di almeno una settimana – precedente alle due giornate di aula – durate il quale sarà richiesto al partecipante di eseguire da casa esercizi propedeutici all’interno della piattaforma online (circa 6-10 ore nell’arco del tempo concesso).
Alla fine del corso verrà rilasciato ai partecipanti l’attestato di partecipazione, l’intero materiale didattico (slides e codice R usato) e una serie di consigli, esercizi e compiti finalizzati a consolidare nel tempo quanto appreso in aula.

Come è organizzato il corso

Il corso consiste in due fasi:

  • Primo, una fase di preparazione individuale da svolgere in autonomia online, da casa o dal lavoro.
  • Secondo, una sessione intensiva e pratica di due giorni in aula per un massimo di 25 partecipanti.

Il corso è un mix di teoria e di pratica: i partecipanti devono portare alla sessione d’aula il proprio computer portatile.
Pranzi e coffee-breaks durante i 2 giorni d’aula sono inclusi. NON sono incluse spese di viaggio ed alloggio.

Per il programma dettagliato si veda il tab “Curriculum” all’inizio di questa pagina.

Le pre-registrazioni sono aperte: è possibile assicurarsi un posto prima del pagamento.

Il corso è stato attivato e si terrà durante il fine settimana del 11 e 12 Maggio 2019 (sabato e domenica).
Orari.  Sabato: 10.00 – 17.30. Domenica: 9.30 – 16.30.

Le due giornate di aula sono precedute da una settimana di accesso alla piattaforma on-line per la preparazione individuale. Gli iscritti avranno automaticamente accesso (dal tab “Curriculum”) a tale contenuto la settimana precedente i giorni d’aula.

Occorre portare il proprio computer portatile: nella pagina “Prima dei Corsi” potete trovare alcuni consigli e i requisiti minimi del computer.

Clicca qui per le indicazioni logistiche su come raggiungere la sede del corso, vitto e alloggi.

Procedura di iscrizione

1) Attivate un account gratuito alla piattaforma (registratevi al sito) cliccando su Account/Sign-up e seguendo le istruzioni.
2) Dopo aver fatto il login con il vostro user-id e password tornate su questa pagina del corso
3) Cliccate sul tasto “Buy this course” e nella pagina successiva su “Place the order”. Questa procedura funge da pre-registrazione, vi assicura il posto e NON richiede il pagamento. Riceverete delle email automatiche di conferma. Nella casella “Additional Information” scrivete le vostre richieste particolari, come ad esempio se avete diritto ad uno sconto (se vi iscrivete con un vostro collega, se siete studenti o dottorandi), o qualsiasi altra vostra richiesta.
4) Attendete una ulteriore comunicazione via email da parte nostra con le indicazioni su come effettuare il pagamento che dovrà essere fatto esclusivamente via bonifico bancario (anche online). L’iscrizione si ritiene finalizzata a pagamento avvenuto.

Riserva il tuo posto al corso già oggi cliccando il tasto “Buy this course” più sotto.
Il corso è tenuto in italiano, il materiale fornito è in lingua inglese. Se hai difficoltà o richieste particolari scrivi a info@infobiology.eu

Costo del corso:

380 euro + IVA (463,60 euro IVA inclusa)

Sconti previsti:

  • tariffa agevolata per studenti e dottorandi: 300 euro +IVA (366 euro IVA inclusa).
  • sconti per gruppi di colleghi (stessa affiliazione/dipartimento/azienda; almeno 2 colleghi): sconto 20% sul costo totale (sconto applicabile anche alla tariffa agevolata studenti/dottorandi!, se provenienti dallo stesso corso di laurea/dipartimento e se richiedono l’iscrizione assieme).

Il costo comprende il corso di due giorni d’aula, l’accesso e il materiale della piattaforma online, catering per i pranzi di sabato e domenica e piccola cancelleria. Gli istitituti e/o enti pubblici che sono IVA esenti possono farlo presente in fase di perfezionamento dell’iscrizione/pagamento.  Per richieste particolari scrivere a info@infobiology.eu

  • 1. Intro2R Infobiology course

    Here you can find the most updated program of the course. Slight modifications can be made without notice: if you have a static (i.e. printed or pdf) version of the program, refer to this online version as the most updated.

  • 2. A gentle introduction

    Introductory and background material on the R environment, course aim, and some data concepts and theory.

    No items in this section
  • 3. Prepare your computer

    Instructions on how to install and approach the software you will need.

    No items in this section
  • 4. Basic R syntax

    The very first basic "how tos" in R

    No items in this section
  • 5. Interactive tutorials

    R methods and data structures: online and offline intractive tutorials

    No items in this section
  • 6. Material used and Resources

    This section contains the files (datasets, scripts and tutorials) that you will need to download during the live course

Instructor

Riccardo L. Rossi Riccardo L. Rossi

Riccardo Lorenzo Rossi si è laureato in Scienze Biologiche presso l'Università degli Studi di Milano e ha conseguito un dottorato in Biotecnologie Industriali all'Università di Milano-Bicocca. Ha 20 anni di esperienza in ricerca in Italia e negli Stati Uniti, prima come biologo molecolare e biochimico, successivamente come analista bioinformatico. Da 10 anni lavora come staff scientist presso l'Istituto Nazionale di Genetica Molecolare (INGM) di Milano, e si è occupato di microRNA, genomica, trascrittomica, analisi dell'esoma e analisi funzionali.
463,60€